健康経営優良法人認定に残業時間・有給取得率は影響する？

影響しません。

ミイダスの健康経営優良法人認定取得支援サービスをご利用いただく上では関係ありません。

ただし、本サービスのご利用は「労働安全衛生法」の内容を遵守いただくことが前提です。